Het klinische beeld van escherichiose is vergelijkbaar met dat van andere diarree-infecties. Daarom wordt de diagnose bevestigd op basis van bacteriologisch onderzoek. Er dient in de eerste dagen van de ziekte materiaal (ontlasting, braaksel, maagspoeling, bloed, urine, cerebrospinaalvocht, gal) te worden afgenomen voordat de patiënt etiotrope therapie krijgt voorgeschreven.