De Krimhemorragische koorts onderscheidt zich van andere hemorragische koortsen, influenza, leptospirose, meningokokkenziekte, tyfus, chirurgische aandoeningen met het syndroom van "acute buik" en van trombocytopenische purpura (ziekte van Werlhof) met een kenmerkend subacuut begin, gebrek aan temperatuurreactie, hemorragische huiduitslag van kleine petechiën tot grote bloeduitstortingen op de flexoroppervlakken van de ledematen en de romp, frequente neusbloedingen en andere bloedingen, hypochrome anemie, leukocytose, trombocytopenie en de afwezigheid van veranderingen in het cardiovasculaire systeem.